氯化钠促进溶菌酶聚集机制的分子动力学研究

关婧; 李辉; 邹志远; 何剑为; 宋有涛

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氯化钠促进溶菌酶聚集机制的分子动力学研究

首发时间：2011-05-16

关婧 ¹
关婧，（1985-），女，硕士研究生，淀粉样脑血管疾病的致病机制研究
李辉 ² 邹志远 ² 何剑为 ² 宋有涛 ²
宋有涛（1973-），男，教授，疯牛病的药物筛选及蛋白质构象的分子动力学模拟研究

1、辽宁大学生命科学院
2、辽宁大学生命科学院，沈阳，110036

摘要：氯化钠能够在一定的条件下促进溶菌酶发生聚集,但其具体的作用机制还尚不明确.本文采用分子动力学模拟的方法研究了鸡溶菌酶单体在500 mM的NaCl和不含NaCl两种体系中的结构变化.模拟的结果表明,一方面NaCl使得溶菌酶聚集关键区域(40-110位残基)内二硫键cys76-cys94的结合强度减弱,同时破坏了该区域内的氢键网络,从而导致了蛋白结构的不稳定性;另一方面, NaCl促使疏水核心发生了一定的扩张,使得疏水核心内氨基酸残基的结合变得更加松散,从而促进了溶菌酶分子间的相互作用.

关键词：溶菌酶氯化钠淀粉样聚集分子动力学模拟

For information in English, please click here

Mechanism study of sodium chloride on lysozyme aggregation investigated by molecular dynamics simulation

Guan Jing ¹
关婧，（1985-），女，硕士研究生，淀粉样脑血管疾病的致病机制研究
Li Hui ² Zou Zhiyuan ² He Jianwei ² Song Youtao ²
宋有涛（1973-），男，教授，疯牛病的药物筛选及蛋白质构象的分子动力学模拟研究

1、College of Life Science,Liaoning University
2、College of Life Science,Liaoning University,shenyang 110036

Abstract：Sodium chloride (NaCl) could induce lysozyme aggregation under certain conditions, but the detail mechanism has been poorly understood. In this study, we performed 10 ns molecular dynamic simulations to investigate the structure changes of chicken lysozyme monomer when treated with 500 mM NaCl. The simulation results indicated that NaCl could weaken the disulfide bond cys76-cys94 as well as the hydrogen bonding network in the aggregation critical region, which might lead instability of the lysozyme structure. In addition, our results also showed that the hydrophobic core had an apparent expanding tendency when treated with NaCl, which might promote the intermolecular interactions between lysozyme mononers.

Keywords： lysozyme sodium chloride amyloid aggregation molecular dynamics simulation

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关婧，李辉，邹志远，等. 氯化钠促进溶菌酶聚集机制的分子动力学研究[EB/OL]. 北京：中国科技论文在线 [2011-05-16]. https://www.paper.edu.cn/releasepaper/content/201105-373.

No.4426439589613130****

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论文编号	201105-373
论文题目	氯化钠促进溶菌酶聚集机制的分子动力学研究
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